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Genomas SARS-CoV-2 Chile

Bienvenido al repositorio nacional de los genomas de SARS-CoV-2

Actores

El Consorcio Genomas CoV2 (CGC) es una respuesta de la comunidad académica y de salud para enfrentar la pandemia COVID-19. Los equipos de investigación de diversos Centros de Excelencia y universidades del país con conocimiento en genómica, bioinformática, virología y epidemiología se han coordinado con el objetivo de crear:

  • 1) Un repositorio nacional de muestras de material genético del virus SARS-CoV-2.
  • 2) Una plataforma informática que procesa, recopila y almacena las secuencias de los genomas del virus obtenidos en Chile.

Además, mediante esta página, ponemos a disposición de la comunidad científica y la sociedad, los análisis filogenómicos (de parentezco por secuencias) derivados de las secuencias obtenidas. Invitamos a la comunidad científica interesada en esta iniciativa a sumarse a ella. Ponemos a disposición de los laboratorios que quieran aportar con nuevas secuencias y datos del genoma de SARS-CoV-2, una serie de herramientas bioinformáticas para generar ensambles y anotaciones.

Análisis

Actualmente contamos con los análisis de los resultados de la secuenciación en el panorama local, junto con el análisis de la metadata proveniente de GISAID para Chile. El repositorio cuenta los datos de las secuencias locales (se compartiran por solicitud). Esperamos que más instituciones se sumen a la iniciativa.

Filogenómica

ÁrbolChileno


Implementación de Auspice. Una herramienta para visualizar de forma interactiva los datos filogenómicos de SARS-CoV-2 desarrollada por nextstrain.org e implementada para esta iniciativa nacional.

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